Ngoài nhiệm vụ là đơn vị cơ động tuần tra bảo vệ chủ quyền lãnh hải tỉnh Thừa Thiên Huế, Đồn BPCK cảng Chân Mây còn là nơi kiểm soát, làm nhiệm vụ xuất nhập cảnh cho tàu thuyền và du khách quốc tế đến làm việc và tham quan tại địa phương.

Các cán bộ, chiến sĩ Đồn BPCK cảng Chân Mây đã nhanh chóng thành lập hệ thống trạm kiểm soát di động ở khu vực cầu cảng, đồng thời triển khai cho cán bộ, chiến sỹ nhanh chóng lên tàu để thực hiện công tác kiểm tra số lượng, rà soát và đối chiếu danh sách đăng ký hành khách, thẻ visa, qua đó tiến hành xác minh và cấp phép nhập cảnh cho du khách.

Do nắm vững quy trình thực hiện cùng với những cải cách mới trong cách làm việc, công tác kiểm tra, xử lý, giải quyết mọi thủ tục hải quan và giấy tờ xuất nhập cảnh cho người nước ngoài đã được đưa vào áp dụng tại đây. Cách làm này khác với việc ký bằng tay cùng một lúc nhiều loại giấy tờ và giao chuyển cho nhiều bộ phận liên quan, khiến cho công tác kiểm tra, thẩm định tốn kém và mất nhiều thời gian, gây nhiều phiền hà và tâm lý lo ngại cho du khách.

Trong khoảng thời gian chưa đến 1 giờ đồng hồ, các cán bộ, chiến sĩ làm nhiệm vụ đã hoàn thành mọi thủ tục kiểm tra và tiến hành cấp chứng chỉ xuất nhập cảnh cho du khách kịp thời tham quan các địa điểm du lịch.