Trong 10 năm qua, thực hiện chương trình phối hợp hoạt động giữa 2 Bộ, nhiều chương trình, đề tài khoa học cấp Nhà nước, cấp Bộ Quốc phòng đã được triển khai nghiên cứu, nghiệm thu đạt kết quả tốt; Các chương trình, đề tài đã được vận dụng vào thực tiễn xây dựng quân đội, huấn luyện, sẵn sàng chiến đấu, góp phần quan trọng vào việc củng cố quốc phòng – an ninh, giữ vững ổn định chính trị của đất nước. Đáng chú ý là một số chương trình KHCN mang tính đặc thù trong lĩnh vực quốc phòng.

Riêng Bộ Tư lệnh BĐBP, hiện toàn lực lượng có 14 Phó Giáo sư, 30 Tiến sỹ, 402 Thạc sỹ, 45 chuyên khoa cấp 1. Trong 10 năm qua, BĐBP đã có 82 Đề tài khoa học được nghiên cứu, trong đó có 4 Đề tài cấp Nhà nước, 15 Đề tài cấp BQP, 7 Đề tài cấp Tổng cục, 56 Đề tài cấp Bộ Tư lệnh…. Thành công của các đề tài đã góp phần hoàn thiện, bổ sung lý luận về công tác biên phòng và xây dựng BĐBP trong tình hình mới, phát triển nghệ thuật quản lý, bảo vệ chủ quyền an ninh biên giới quốc gia, xây dựng cơ sở lý luận và thực tiễn để bổ sung, hoàn thiện các văn bản qui phạm pháp luật của BĐBP, BQP và của Đảng, Nhà nước trong quản lý, bảo vệ chủ quyền an ninh biên giới quốc gia...

Thời gian tới, hai Bộ sẽ tiếp tục phối hợp hoạt động theo phương châm “Thiết thực – khả thi – chất lượng – kịp thời – hiệu quả”. Trong đó, tập trung vào triển khai có hiệu quả các định hướng nhiệm vụ KHCN; tăng cường nghiên cứu lý luậ, phát triển nghệ thuật quân sự Việt Nam; Nghệ thuật chiến tranh nhân dân, bảo vệ Tổ quốc trong điều kiện mới; Xây dựng nền quốc phòng toàn dân; Chủ động ngăn ngừa và sẵn sàng đánh thắng mọi cuộc chiến tranh…